一. 為避免嗆到，檢查後一小時內禁止大力咳嗽、喝水或禁用食物，一小時先喝少許的水，若沒有嗆到或其他不適，才可以開始進食。

二. 檢查時含於口中的局部麻醉劑及口服消泡劑，少數人可能會有暫時不適(如頭暈、噁心等)。

三. 檢查前使用之注射藥物，少數人可能會有頭暈、噁心、口乾、視力模糊或心悸等暫時性之副作用,若症狀持續請向醫師報告且返院回診。

四. 檢查後若有明顯腹痛、胸骨下痛、出血﹝如：吐血或解黑便、血便等﹞情形，請向醫師報告或回急診處處理。

五、若有短暫一兩天的喉嚨不舒服時，大都會自然消退，但若仍持續喉嚨痛時，請返院回診。